MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 22549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	488657417
2	NC_021179	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
3	NC_021179	C	6	6	280	285	0 %	0 %	0 %	100 %	488657417
4	NC_021179	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	488657417
5	NC_021179	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
6	NC_021179	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657417
7	NC_021179	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657417
8	NC_021179	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
9	NC_021179	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657417
10	NC_021179	A	9	9	628	636	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
11	NC_021179	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
12	NC_021179	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	488657417
13	NC_021179	T	7	7	678	684	0 %	100 %	0 %	0 %	488657417
14	NC_021179	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657417
15	NC_021179	A	9	9	742	750	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
16	NC_021179	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
17	NC_021179	A	7	7	886	892	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
18	NC_021179	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657417
19	NC_021179	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
20	NC_021179	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	488657417
21	NC_021179	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
22	NC_021179	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
23	NC_021179	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
24	NC_021179	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657417
25	NC_021179	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657417
26	NC_021179	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
27	NC_021179	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657417
28	NC_021179	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657417
29	NC_021179	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	488657417
30	NC_021179	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	488657417
31	NC_021179	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	488657418
32	NC_021179	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	488657418
33	NC_021179	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657418
34	NC_021179	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	488657418
35	NC_021179	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	488657418
36	NC_021179	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657418
37	NC_021179	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657418
38	NC_021179	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657418
39	NC_021179	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	488657418
40	NC_021179	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657418
41	NC_021179	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	488657418
42	NC_021179	A	8	8	1710	1717	100 %	0 %	0 %	0 %	488657419
43	NC_021179	T	6	6	1726	1731	0 %	100 %	0 %	0 %	488657419
44	NC_021179	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657419
45	NC_021179	T	6	6	1846	1851	0 %	100 %	0 %	0 %	488657419
46	NC_021179	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
47	NC_021179	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657419
48	NC_021179	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
49	NC_021179	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	488657419
50	NC_021179	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657419
51	NC_021179	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	488657419
52	NC_021179	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
53	NC_021179	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657419
54	NC_021179	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	488657419
55	NC_021179	A	7	7	2182	2188	100 %	0 %	0 %	0 %	488657419
56	NC_021179	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657419
57	NC_021179	T	8	8	2313	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	488657419
58	NC_021179	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657419
59	NC_021179	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657419
60	NC_021179	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
61	NC_021179	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657419
62	NC_021179	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657419
63	NC_021179	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657419
64	NC_021179	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
65	NC_021179	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	488657419
66	NC_021179	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657419
67	NC_021179	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657419
68	NC_021179	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657419
69	NC_021179	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	488657420
70	NC_021179	T	8	8	2837	2844	0 %	100 %	0 %	0 %	488657420
71	NC_021179	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657420
72	NC_021179	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	488657420
73	NC_021179	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	488657420
74	NC_021179	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	488657420
75	NC_021179	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	488657420
76	NC_021179	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	488657420
77	NC_021179	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657420
78	NC_021179	T	6	6	3109	3114	0 %	100 %	0 %	0 %	488657420
79	NC_021179	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657420
80	NC_021179	AACAAA	2	12	3231	3242	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	488657420
81	NC_021179	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	488657420
82	NC_021179	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657420
83	NC_021179	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657420
84	NC_021179	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657420
85	NC_021179	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	488657420
86	NC_021179	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657420
87	NC_021179	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657420
88	NC_021179	A	6	6	3788	3793	100 %	0 %	0 %	0 %	488657420
89	NC_021179	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657420
90	NC_021179	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	488657421
91	NC_021179	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	488657421
92	NC_021179	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	488657421
93	NC_021179	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657421
94	NC_021179	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	488657421
95	NC_021179	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657421
96	NC_021179	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657421
97	NC_021179	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
98	NC_021179	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
99	NC_021179	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	488657422
100	NC_021179	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	488657422
101	NC_021179	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	488657422
102	NC_021179	A	6	6	4816	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	488657422
103	NC_021179	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
104	NC_021179	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
105	NC_021179	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657422
106	NC_021179	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
107	NC_021179	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
108	NC_021179	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657422
109	NC_021179	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657422
110	NC_021179	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	488657422
111	NC_021179	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
112	NC_021179	TTTGAC	2	12	5642	5653	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	488657422
113	NC_021179	GCAGGC	2	12	5659	5670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	488657422
114	NC_021179	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657422
115	NC_021179	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
116	NC_021179	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	488657422
117	NC_021179	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657422
118	NC_021179	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	488657422
119	NC_021179	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657422
120	NC_021179	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
121	NC_021179	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657422
122	NC_021179	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657422
123	NC_021179	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
124	NC_021179	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	488657422
125	NC_021179	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	488657422
126	NC_021179	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	488657422
127	NC_021179	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657422
128	NC_021179	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657422
129	NC_021179	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	488657422
130	NC_021179	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
131	NC_021179	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657422
132	NC_021179	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	488657422
133	NC_021179	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657422
134	NC_021179	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657422
135	NC_021179	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	488657422
136	NC_021179	GTGTAT	2	12	6685	6696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	488657422
137	NC_021179	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	488657422
138	NC_021179	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657422
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